Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công ty dịch vụ kế toán ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Tính hợp lý của yêu cầu từ cán bộ thuế

Yêu cầu của cán bộ thuế về việc tìm nguyên nhân khoản thuế thu nhập cá nhân (TNCN) nộp thừa lũy tiến từ năm 2010 trước khi thực hiện kiểm tra thuế là hợp lý một phần, nhưng không phải là yêu cầu bắt buộc tuyệt đối theo quy định pháp luật. Theo Luật Quản lý thuế 2019, cơ quan thuế có quyền kiểm tra, thanh tra để xác định số tiền thuế nộp thừa hoặc thiếu, đặc biệt trong trường hợp quyết toán thuế khi giải thể doanh nghiệp.

Tuy nhiên, nếu hồ sơ lưu trữ không đầy đủ do thời gian dài người nộp thuế không bắt buộc phải tự tìm ra nguyên nhân chính xác mà chỉ cần cung cấp các tài liệu liên quan còn lại để cơ quan thuế tiến hành kiểm tra.

Việc yêu cầu này có thể xuất phát từ nhu cầu làm rõ để tránh sai sót, nhưng nếu hồ sơ không đầy đủ, Anh/Chị có quyền đề nghị cơ quan thuế tiến hành kiểm tra dựa trên dữ liệu hệ thống và tài liệu hiện có, tránh trì hoãn thủ tục giải thể.

Phương án xử lý khoản thuế nộp thừa khi giải thể công ty

Xem thêm: Em xuất hóa đơn giá trị gia tăng cho khách lẻ bằng căn cước công dân thì xuất theo địa chỉ trên căn cước công dân khách gửi hay phải tra địa chỉ mới ạ?

Để xử lý khoản thuế TNCN nộp thừa lũy tiến từ 2010 trong thủ tục giải thể, Anh/Chị cần tập trung vào việc yêu cầu hoàn thuế hoặc bù trừ theo quy định, đồng thời phối hợp với cơ quan thuế để vượt qua yêu cầu kiểm tra.

Theo Thông tư 94/2025/TT-BTC khoản nộp thừa thuế TNCN có thể được hoàn lại nếu đáp ứng điều kiện quyết toán và không có nợ thuế khác.

Dưới đây là hướng dẫn cụ thể theo quy trình xử lý:

Bước 1: Chuẩn bị và nộp hồ sơ yêu cầu hoàn thuế

Thu thập các tài liệu còn lại liên quan đến khoản nộp thừa từ 2010, bao gồm biên lai nộp thuế, tờ khai quyết toán TNCN, và báo cáo tài chính công ty. Nếu hồ sơ không đầy đủ, lập văn bản giải trình kèm theo các chứng từ thay thế. Nộp hồ sơ tại Chi cục Thuế quản lý trực tiếp, kèm theo đơn đề nghị hoàn thuế theo mẫu

Thời hạn xử lý là 40 ngày kể từ ngày nhận hồ sơ hợp lệ theo luật Quản lý thuế 2019.

Xem thêm: Anh chị trong nhóm cho em hỏi với ạ. Giám đốc bên em không hưởng lương, đóng bảo hiểm xã hội từ khi thành lập (năm 2021) đến giờ bằng tiền của giám đốc. Hiện giờ em muốn xin cấp mã đơn vị cho nhóm không hưởng lương để quản lý riêng thì có phải báo giảm giám đốc trước, sau đó lập hồ sơ 604 để xin cấp mã đơn vị nhóm không hưởng lương, rồi lại báo tăng mới giám đốc không ạ? Bác nào có kinh nghiệm chỉ giúp em với ạ, em cảm ơn.

Bước 2: Phối hợp kiểm tra và giải trình với cơ quan thuế

Gửi văn bản đề nghị cơ quan thuế tiến hành kiểm tra ngay dựa trên dữ liệu hệ thống CQT. Nếu cán bộ thuế vẫn yêu cầu thêm thông tin, cung cấp bằng chứng về việc hồ sơ bị mất mát do thời gian. Kiểm tra quyết toán chỉ giới hạn trong 10 năm gần nhất, nhưng với dữ liệu cũ từ 2010, cơ quan thuế có thể sử dụng phương pháp ước tính nếu cần. Quá trình này không được kéo dài quá 30 ngày, trừ trường hợp phức tạp.

Bước 3: Theo dõi và nhận hoàn thuế hoặc bù trừ

Sau kiểm tra, nếu xác nhận nộp thừa, cơ quan thuế sẽ hoàn tiền trong 40 ngày hoặc bù trừ vào các khoản nợ thuế khác (nếu có). Nếu từ chối hoàn, Anh/Chị có quyền khiếu nại theo Luật Quản lý thuế 2019.

Lưu ý, khoản hoàn thuế TNCN không chịu lãi chậm nộp, nhưng nếu có sai sót từ phía cơ quan thuế, có thể yêu cầu bồi thường theo quy định.

• Hồ sơ cần chuẩn bị chính:
• Đơn đề nghị hoàn thuế
• Biên lai nộp thuế thừa từ 2010 (hoặc sao y nếu gốc mất).
• Tờ khai quyết toán thuế TNCN các năm liên quan.
• Văn bản giải trình lý do hồ sơ không đầy đủ.
• Giấy xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế khác (để hỗ trợ giải thể).

Việc tuân thủ quy trình này giúp đảm bảo thủ tục giải thể diễn ra suôn sẻ, tránh phạt chậm giải thể và bảo vệ quyền lợi hoàn thuế. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công ty dịch vụ kế toán ACC.