Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công ty dịch vụ kế toán ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Quy định về xuất hóa đơn cho hộ kinh doanh nhóm 2 trong lĩnh vực phòng khám chữa bệnh

Hộ kinh doanh cá thể nhóm 2 (tổng doanh thu hàng năm từ 500 triệu đồng – 3 tỷ đồng) thuộc lĩnh vực y tế phải sử dụng hóa đơn điện tử theo quy định tại Nghị định 123/2020/NĐ-CP về hóa đơn, chứng từ và Thông tư 20/2026/TT-BTC quy định chi tiết một số điều của Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp và Nghị định 320/2025/NĐ-CP. Đối với dịch vụ siêu âm hoặc chụp phim, đây là dịch vụ y tế không chịu thuế giá trị gia tăng (GTGT) theo Luật Thuế GTGT 2024, nên hóa đơn xuất ra là hóa đơn bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ (không tính thuế GTGT). Hộ kinh doanh cần đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử với cơ quan thuế trước khi hoạt động, theo Quyết định 1510/QĐ-TCT của Tổng cục Thuế về việc ban hành Quy trình sử dụng hóa đơn điện tử.

Quy trình xuất hóa đơn từ máy tính tiền cho dịch vụ siêu âm và chụp phim

Vì hộ kinh doanh nhóm 2 phải sử dụng máy tính tiền kết nối chuyển dữ liệu điện tử với cơ quan thuế theo Điều 25 Nghị định 123/2020/NĐ-CP, quy trình xuất hóa đơn được thực hiện qua phần mềm máy tính tiền tích hợp hóa đơn điện tử. Dưới đây là các bước cụ thể:

Xem thêm: Mọi người ơi cho em hỏi, em đăng ký phần mềm mới được thuế chấp thuận rồi. Mà phần mềm cũ em còn mấy chục hóa đơn nữa, thì em có dùng nốt được không và hóa đơn bên cũ còn được chấp thuận không ạ?

Bước 1: Chuẩn bị và đăng ký máy tính tiền

Hộ kinh doanh cần mua hoặc lắp đặt máy tính tiền đạt chuẩn theo Thông tư 20/2026/TT-BTC, đảm bảo kết nối internet và phần mềm được cơ quan thuế chấp thuận. Đăng ký sử dụng với Chi cục Thuế quản lý qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế (etax.gdt.gov.vn), cung cấp thông tin về loại hình kinh doanh y tế. Thời hạn đăng ký trước khi xuất hóa đơn đầu tiên là 3 ngày làm việc, tránh phạt hành chính theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

Bước 2: Thực hiện giao dịch và xuất hóa đơn

Khi khách hàng sử dụng dịch vụ siêu âm hoặc chụp phim, nhân viên nhập dữ liệu vào máy tính tiền (tên dịch vụ, số lượng, đơn giá, tổng tiền không bao gồm GTGT). Hệ thống tự động tạo hóa đơn điện tử với mã của cơ quan thuế, gửi ngay cho khách hàng qua email, SMS hoặc in tạm thời. Hóa đơn phải ghi rõ "Dịch vụ y tế không chịu thuế GTGT" và thông tin hộ kinh doanh (mã số thuế, địa chỉ). Dữ liệu giao dịch được truyền tự động đến cơ quan thuế trong vòng 1 ngày theo Điều 25 Nghị định 123/2020/NĐ-CP.

Bước 3: Lưu trữ và báo cáo

Sau khi xuất, hóa đơn được lưu trữ điện tử ít nhất 10 năm theo Luật Kế toán 2015. Hộ kinh doanh kê khai thuế hàng quý hoặc tháng qua hệ thống etax, bao gồm doanh thu từ dịch vụ y tế. Nếu phát sinh lỗi, hủy hoặc điều chỉnh hóa đơn phải tuân thủ Thông tư 20/2026/TT-BTC, thông báo cơ quan thuế trong 3 ngày.

Xem thêm: Cả nhà ơi, mình chỉ bán sàn Shopee thì lập hộ kinh doanh chọn mã ngành nào vậy ạ?

Hóa đơn đầu vào cần thiết để hỗ trợ xuất hóa đơn đầu ra

Để có cơ sở khấu trừ chi phí và xuất hóa đơn đầu ra hợp pháp, hộ kinh doanh cần thu thập hóa đơn đầu vào hợp lệ cho các khoản chi như thiết bị y tế, vật tư tiêu hao (máy siêu âm, phim chụp). Các hóa đơn đầu vào phải là hóa đơn điện tử từ nhà cung cấp, ghi rõ nội dung chi phí liên quan đến hoạt động y tế, theo Điều 15 Nghị định 123/2020/NĐ-CP.

• Hóa đơn mua thiết bị, thuốc men từ nhà cung cấp có mã số thuế.
• Chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt nếu giá trị từ 20.000.000 đồng trở lên (theo Luật Thuế GTGT).
• Biên bản kiểm kê, hợp đồng dịch vụ nếu áp dụng.

Những hóa đơn này giúp hộ kinh doanh xác định chi phí hợp lý khi quyết toán thuế theo phương pháp kê khai (nếu áp dụng cho nhóm 2), tránh rủi ro truy thu thuế trên số thuế trốn theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

Việc tuân thủ quy định xuất hóa đơn giúp hộ kinh doanh tránh phạt hành chính, đảm bảo minh bạch tài chính và dễ dàng kê khai thuế, từ đó hỗ trợ phát triển bền vững hoạt động phòng khám. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công ty dịch vụ kế toán ACC.