Thuế GTGT đối với hợp đồng hợp tác kinh doanh là vấn đề pháp lý quan trọng mà các doanh nghiệp cần nắm rõ để đảm bảo tuân thủ nghĩa vụ thuế khi thực hiện hợp đồng hợp tác kinh doanh. Việc hiểu đúng quy định giúp tránh rủi ro pháp lý và tối ưu chi phí. Cùng Công ty dịch vụ kế toán ACC tìm hiểu chi tiết các quy định hiện hành.

1. Quy định thuế GTGT đối với hợp đồng hợp tác kinh doanh

Theo Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, hợp đồng hợp tác kinh doanh được xác định là hoạt động sản xuất kinh doanh có phát sinh doanh thu chịu thuế giá trị gia tăng. Các bên tham gia hợp đồng phải thực hiện kê khai thuế GTGT trên toàn bộ doanh thu từ hoạt động hợp tác, trừ các trường hợp được miễn giảm theo quy định. Nghị định 181/2025/NĐ-CP quy định rõ tỷ lệ phân bổ thuế GTGT giữa các bên dựa trên tỷ lệ góp vốn hoặc tỷ lệ chia lợi nhuận đã thỏa thuận trong hợp đồng. Thông tư 69/2025/TT-BTC hướng dẫn cách xác định giá tính thuế là giá chưa có thuế GTGT, bao gồm cả khoản thu từ việc cung cấp hàng hóa, dịch vụ trong khuôn khổ hợp đồng hợp tác. Doanh nghiệp cần xác định đúng đối tượng chịu thuế để tránh bị xử phạt vi phạm hành chính.

2. Đối tượng chịu thuế GTGT trong hợp đồng hợp tác kinh doanh

Đối tượng chịu thuế GTGT bao gồm toàn bộ doanh thu phát sinh từ việc cung cấp hàng hóa, dịch vụ theo hợp đồng hợp tác kinh doanh. Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 quy định các bên tham gia phải chịu trách nhiệm liên đới về nghĩa vụ thuế nếu không có thỏa thuận phân định rõ ràng. Nghị định 181/2025/NĐ-CP bổ sung quy định về trường hợp một bên là tổ chức nước ngoài tham gia hợp đồng thì bên Việt Nam có trách nhiệm khấu trừ và nộp thuế thay. Thông tư 69/2025/TT-BTC hướng dẫn chi tiết các khoản thu nhập được coi là doanh thu chịu thuế, bao gồm cả khoản tiền hỗ trợ, thưởng từ hoạt động hợp tác. Việc xác định đúng đối tượng giúp doanh nghiệp tính toán chính xác số thuế phải nộp và lập hồ sơ kê khai đầy đủ.

Xem thêm: Mẫu tờ khai 01 ĐK TCT đăng ký thuế cho tổ chức

3. Cách tính thuế GTGT theo quy định mới

Thuế GTGT được tính theo công thức: Thuế GTGT phải nộp = Giá tính thuế x Thuế suất. Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 quy định thuế suất áp dụng cho hoạt động hợp đồng hợp tác kinh doanh là 10% đối với hầu hết các lĩnh vực, trừ một số trường hợp áp dụng thuế suất 5% hoặc 0%. Nghị định 181/2025/NĐ-CP hướng dẫn phương pháp tính thuế theo tỷ lệ phân chia lợi nhuận hoặc theo doanh thu thực tế phát sinh. Thông tư 69/2025/TT-BTC quy định cách xác định giá tính thuế khi có yếu tố chiết khấu, khuyến mãi hoặc bù trừ giữa các bên. Doanh nghiệp cần áp dụng đúng phương pháp tính để đảm bảo số thuế kê khai chính xác và phù hợp với thực tế hoạt động.

Xem thêm: Tờ khai đăng ký thuế mẫu số 04.1 ĐK TCT nhà thầu mới nhất

4. Nghĩa vụ kê khai và nộp thuế GTGT

Các bên tham gia hợp đồng hợp tác kinh doanh có trách nhiệm kê khai thuế GTGT theo tháng hoặc quý tùy theo quy mô doanh thu. Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 yêu cầu nộp tờ khai thuế chậm nhất ngày 20 của tháng sau hoặc ngày 30 của quý sau. Nghị định 181/2025/NĐ-CP quy định bên được ủy quyền kê khai phải gửi thông báo cho cơ quan thuế trong vòng 5 ngày làm việc kể từ ngày ký hợp đồng. Thông tư 69/2025/TT-BTC hướng dẫn hồ sơ nộp thuế bao gồm tờ khai thuế, bảng phân bổ thuế và chứng từ liên quan. Việc thực hiện đúng nghĩa vụ kê khai giúp doanh nghiệp tránh bị truy thu thuế và các khoản phạt liên quan.

5. Câu hỏi thường gặp

Hợp đồng hợp tác kinh doanh có phải kê khai thuế GTGT riêng không?

Trả lời: Theo Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 và Nghị định 181/2025/NĐ-CP, các bên có thể thỏa thuận một bên kê khai thay cho cả hợp đồng, nhưng phải thông báo cho cơ quan thuế và chịu trách nhiệm liên đới về số thuế phải nộp. Việc này giúp đơn giản hóa thủ tục nhưng vẫn đảm bảo tuân thủ quy định.

Thuế suất GTGT áp dụng cho hợp đồng hợp tác kinh doanh là bao nhiêu?

Trả lời: Thông tư 69/2025/TT-BTC quy định thuế suất cơ bản là 10%, một số hoạt động đặc thù được áp dụng thuế suất 5% hoặc 0% tùy theo lĩnh vực. Doanh nghiệp cần căn cứ vào nội dung hợp đồng để xác định thuế suất chính xác.

Có được khấu trừ thuế GTGT đầu vào khi thực hiện hợp đồng hợp tác kinh doanh không?

Trả lời: Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 cho phép khấu trừ thuế GTGT đầu vào nếu có hóa đơn hợp lệ và hàng hóa, dịch vụ được sử dụng cho hoạt động chịu thuế. Nghị định 181/2025/NĐ-CP hướng dẫn cách phân bổ thuế đầu vào giữa các bên theo tỷ lệ góp vốn.

Thuế GTGT đối với hợp đồng hợp tác kinh doanh cần được các doanh nghiệp quan tâm và thực hiện đúng quy định để đảm bảo hoạt động kinh doanh hợp pháp. Việc nắm rõ các quy định tại Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, Nghị định 181/2025/NĐ-CP và Thông tư 69/2025/TT-BTC giúp giảm thiểu rủi ro. Liên hệ Công ty dịch vụ kế toán ACC để được tư vấn chi tiết và hỗ trợ thực hiện nghĩa vụ thuế hiệu quả.