Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công ty dịch vụ kế toán ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Lý do tờ khai bị từ chối

Tờ khai giá trị gia tăng (GTGT) quý 4 năm 2025 bị cơ quan thuế từ chối tiếp nhận với lỗi "Kỳ kê khai của tờ khai không phù hợp với nghĩa vụ kê khai của người nộp thuế" thường xuất phát từ việc hệ thống quản lý thuế điện tử (như eTax) nhận diện rằng doanh nghiệp đã tạm ngừng hoạt động từ tháng 10/2025, dẫn đến sự không khớp giữa kỳ kê khai và tình trạng nghĩa vụ thuế hiện tại. Theo Điều 44 Luật Quản lý thuế 2019, người nộp thuế phải kê khai đầy đủ, chính xác và đúng hạn, nhưng khi tạm ngừng kinh doanh, nghĩa vụ kê khai có thể bị ảnh hưởng nếu không có phát sinh doanh thu hoặc hóa đơn trong kỳ. Nghị định 126/2020/NĐ-CP (Điều 7 và Điều 47) quy định chi tiết về kê khai điện tử, nhấn mạnh rằng hệ thống sẽ tự động kiểm tra tính phù hợp dựa trên thông báo tạm ngừng đã nộp trước đó (theo Điều 54 Luật Quản lý thuế 2019). Trong trường hợp này, dù nộp ngày 26/01/2026 (trong thời hạn 30 ngày kể từ ngày kết thúc quý theo Điều 45 Luật Quản lý thuế 2019), lỗi có thể do thông báo tạm ngừng từ tháng 10/2025 khiến hệ thống coi quý 4/2025 là kỳ không phát sinh nghĩa vụ, đặc biệt nếu tờ khai ghi số liệu không phù hợp (ví dụ: kê khai số 0 nhưng hệ thống yêu cầu điều chỉnh).

Nghĩa vụ kê khai thuế GTGT khi tạm ngừng hoạt động

Xem thêm: Dạ mọi người cho mình hỏi. Bên mình có nhân viên đang nghỉ thai sản và nếu được thưởng tết 20 triệu thì tiền thưởng đó tính thuế thu nhập cá nhân và được quyết toán, hạch toán thế nào ạ?

Doanh nghiệp tạm ngừng kinh doanh vẫn phải thực hiện nghĩa vụ kê khai thuế GTGT theo phương pháp kê khai đã đăng ký (quý hoặc tháng), trừ trường hợp được cơ quan thuế chấp thuận thay đổi. Cụ thể, theo Điều 54 Luật Quản lý thuế 2019, doanh nghiệp phải thông báo tạm ngừng ít nhất 1 ngày trước (hoặc 45 ngày nếu tạm ngừng trên 1 năm), và trong thời gian tạm ngừng, nếu không có hoạt động phát sinh, vẫn nộp tờ khai với số liệu bằng 0 để tránh bị coi là trốn tránh nghĩa vụ. Nghị định 126/2020/NĐ-CP (Điều 10) quy định rõ: Kê khai thuế GTGT quý áp dụng cho doanh nghiệp có doanh thu năm trước dưới 50 tỷ đồng, và tạm ngừng không tự động hủy nghĩa vụ này trừ khi có quyết định chấm dứt mã số thuế. Nếu tạm ngừng từ tháng 10/2025 (bắt đầu quý 4), doanh nghiệp vẫn phải kê khai toàn bộ quý 4 với số liệu thực tế (bằng 0 cho các tháng tạm ngừng), nếu không sẽ bị phạt chậm nộp theo Luật Quản lý thuế 2019 (trên số thuế chậm nộp).

Để xử lý tình huống bị từ chối, Anh/Chị cần kiểm tra và điều chỉnh tờ khai theo quy trình sau, đảm bảo tuân thủ kê khai điện tử qua hệ thống eTax hoặc iHTKK.

Bước 1: Kiểm tra thông báo tạm ngừng và dữ liệu tờ khai

Truy cập tài khoản eTax để xác nhận thông báo tạm ngừng đã được ghi nhận từ tháng 10/2025, đồng thời kiểm tra nội dung tờ khai quý 4/2025 (số liệu GTGT đầu vào/đầu ra phải bằng 0 nếu không phát sinh). Nếu có sai sót như ghi nhầm kỳ hoặc phương pháp kê khai, tải mẫu tờ khai 01/GTGT (theo Phụ lục Nghị định 126/2020/NĐ-CP) và chỉnh sửa. Việc này giúp tránh lỗi hệ thống, vì theo Điều 47 Nghị định 126/2020/NĐ-CP, tờ khai phải khớp với hồ sơ đăng ký thuế.

Bước 2: Liên hệ cơ quan thuế để xác nhận lý do từ chối

Xem thêm: Anh chị ơi, mã chương của doanh nghiệp đầu tư trực tiếp nước ngoài để nộp thuế là bao nhiêu thế ạ, vốn 60% nước ngoài.

Gửi email hoặc gọi hotline Chi cục Thuế quản lý (số điện thoại trên thông báo từ chối) để hỏi chi tiết lỗi, kèm theo file tờ khai đã nộp. Cơ quan thuế sẽ hướng dẫn cụ thể dựa trên Điều 109 Luật Quản lý thuế 2019 về hỗ trợ người nộp thuế. Thời gian xử lý thường trong 3-5 ngày làm việc; nếu cần, chuẩn bị hồ sơ khiếu nại theo mẫu tại Nghị định 126/2020/NĐ-CP (Điều 60), tránh phạt hành chính nếu chậm khắc phục (Luật Quản lý thuế 2019).

Bước 3: Nộp lại tờ khai đã điều chỉnh

Sau khi chỉnh sửa, nộp lại qua eTax trước ngày 20/02/2026 (thời hạn gia hạn nếu có lý do chính đáng theo Điều 45 Luật Quản lý thuế 2019). In và lưu biên bản nộp để theo dõi. Nếu hệ thống vẫn từ chối, nộp bản giấy trực tiếp tại Chi cục Thuế kèm giải trình (hồ sơ bao gồm: – Tờ khai GTGT quý 4/2025 đã ký; – Thông báo tạm ngừng; – Giải trình lỗi từ chối). Theo Nghị định 126/2020/NĐ-CP (Điều 48), nộp lại thành công sẽ hủy tờ khai cũ và tính từ ngày nộp mới.

Việc tuân thủ kịp thời giúp tránh phạt chậm kê khai và duy trì uy tín mã số thuế. Công ty dịch vụ kế toán ACC khuyến nghị kiểm tra định kỳ để đảm bảo tuân thủ. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công ty dịch vụ kế toán ACC.