Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công ty dịch vụ kế toán ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Xử lý hóa đơn chiết khấu cho hộ kinh doanh khai thuế khoán

Khi công ty xuất hóa đơn chiết khấu thương mại cho khách hàng là hộ kinh doanh áp dụng phương pháp kê khai, cần tuân thủ quy định về hóa đơn điện tử và điều chỉnh giá trị hóa đơn. Theo Nghị định 123/2020/NĐ-CP (Điều 18) và Thông tư 20/2026/TT-BTC, chiết khấu thương mại được xử lý bằng cách lập hóa đơn điều chỉnh giảm giá trị hàng hóa, dịch vụ tương ứng với mức chiết khấu, kèm theo hóa đơn gốc. Hộ kinh doanh khai thuế khoán không được khấu trừ thuế GTGT đầu vào, nên phần chiết khấu chỉ ảnh hưởng đến cơ sở tính thuế khoán của họ theo tỷ lệ phần trăm doanh thu (theo 18/2026/TT-BTC). Công ty cần lưu trữ hóa đơn điều chỉnh này làm cơ sở hạch toán giảm doanh thu và thuế GTGT đầu ra.

Hồ sơ kê khai thay và nộp hộ tiền thuế

Công ty có trách nhiệm kê khai thay và nộp hộ tiền thuế cho hộ kinh doanh nếu có thỏa thuận rõ ràng, nhằm đảm bảo hộ hoàn thành nghĩa vụ thuế theo phương pháp khoán. Theo Thông tư 18/2026/TT-BTC, doanh nghiệp được phép nộp thay thuế GTGT và thuế TNCN kê khai cho hộ kinh doanh dựa trên hợp đồng hoặc biên bản thỏa thuận. Các hồ sơ cần chuẩn bị và kê khai bao gồm:

• Biên bản thỏa thuận nộp thay thuế giữa công ty và hộ kinh doanh, ghi rõ số tiền thuế, loại thuế (GTGT, TNCN theo khoán) và thời hạn nộp.
• Bảng kê tính thuế khoán của hộ kinh doanh (dựa trên doanh thu sau chiết khấu), lập theo mẫu tại Phụ lục Thông tư 40/2021/TT-BTC.
• Bản sao hóa đơn chiết khấu và hóa đơn gốc để chứng minh cơ sở tính thuế.
• Chứng từ nộp tiền thuế (phiếu thu ngân sách nhà nước hoặc xác nhận chuyển khoản), kèm mã số thuế của hộ kinh doanh.

Xem thêm: Giúp mình với công ty tạm dừng 2 năm. Nay vào nộp tờ khai đã cập nhật phần mềm đầy đủ nhưng nộp tờ khai vẫn báo như thế này. Mẫu tờ khai đã được nâng cấp trên Hệ thống Thông tin giải quyết thủ tục hành chính của cơ quan thuế. Người nộp thuế vui lòng thực hiện tại: Anh chị em giúp xem là lỗi như thế nào với ạ.

Công ty kê khai các hồ sơ này vào sổ sách kế toán (tài khoản chi phí quản lý kinh doanh hoặc thu nhập khác) và lưu trữ để đối chiếu khi cơ quan thuế kiểm tra, đồng thời báo cáo trong báo cáo tài chính hàng năm theo Luật Kế toán 2015.

Quy trình nộp tiền thuế hộ và mã chương ngân sách

Việc nộp hộ tiền thuế cần thực hiện qua hệ thống ngân hàng hoặc kho bạc nhà nước, sử dụng mã số thuế của hộ kinh doanh để đảm bảo tiền về đúng tài khoản. Theo Thông tư 18/2026/TT-BTC và Nghị định 123/2020/NĐ-CP (quy định về hóa đơn, chứng từ), quy trình được thực hiện như sau:

Bước 1: Xác định số tiền thuế cần nộp hộ

Dựa trên doanh thu của hộ sau chiết khấu, tính thuế khoán theo tỷ lệ tại Thông tư 18/2026/TT-BTC (ví dụ: thuế GTGT 1-5% trên doanh thu, thuế TNCN 0,5-2%). Công ty lập bảng kê chi tiết, ký xác nhận với hộ kinh doanh để tránh tranh chấp sau này. Thời gian tính thuế thường theo quý hoặc năm, tùy thỏa thuận.

Bước 2: Chuẩn bị chứng từ nộp tiền

Xem thêm: Công ty em thành lập 2008 đã tăng vốn lần 1 năm 2011, đến năm 2025 lại tăng vốn nhưng không tăng bậc thuế môn bài. Vậy đầu năm 2026 em có phải kê khai tờ khai thuế môn bài không ạ. Nếu kê thì tờ khai chính thức 2026 hay bổ sung 2025 ạ. Bác nào kê trên dịch vụ công rồi cho em xin cách kê với ạ. Em cảm ơn các bác nhiều ạ.

Lập giấy đề nghị nộp thuế thay (theo mẫu tại Thông tư 18/2026/TT-BTC), kèm biên bản thỏa thuận và bảng kê thuế. Sử dụng phần mềm kê khai thuế điện tử (eTax) để tạo mã nộp, đảm bảo liên kết với hóa đơn chiết khấu đã xuất theo Nghị định 123/2020/NĐ-CP.

Bước 3: Nộp tiền vào ngân sách

Chuyển khoản hoặc nộp trực tiếp tại kho bạc/khách hàng ngân hàng, sử dụng mã chương ngân sách tương ứng với loại thuế. Đối với thuế GTGT và TNCN theo phương pháp khoán của hộ kinh doanh, nộp vào chương 1102 (Thuế giá trị gia tăng), tiểu mục 110202 (Thuế GTGT theo phương pháp trực tiếp trên doanh thu) cho phần GTGT; và chương 1103 (Thuế thu nhập cá nhân), tiểu mục 110301 cho phần TNCN. Số tiền nộp phải khớp chính xác với bảng kê, và công ty nhận biên lai để giao cho hộ kinh doanh.

Bước 4: Báo cáo và lưu trữ

Sau khi nộp, cập nhật vào hệ thống kế toán của công ty và gửi báo cáo nộp thay cho cơ quan thuế địa phương (nếu yêu cầu) qua eTax trong thời hạn 10 ngày kể từ ngày nộp. Lưu trữ toàn bộ hồ sơ ít nhất 10 năm theo Luật Quản lý thuế 2019 (Điều 55).

Việc tuân thủ các quy định trên giúp công ty tránh rủi ro phạt hành chính do kê khai sai hoặc chậm nộp (theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP), đồng thời đảm bảo minh bạch trong giao dịch với hộ kinh doanh. Tuân thủ còn hỗ trợ tối ưu hóa chi phí thuế cho cả hai bên. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công ty dịch vụ kế toán ACC.