Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công ty dịch vụ kế toán ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Quy định về việc xuất hóa đơn cho phòng khám

Theo Nghị định 123/2020/NĐ-CP quy định về hóa đơn, chứng từ, các cơ sở kinh doanh như phòng khám được phép xuất hóa đơn điện tử để ghi nhận doanh thu từ hoạt động cung cấp hàng hóa và dịch vụ. Hóa đơn phải thể hiện rõ ràng, đầy đủ nội dung hàng hóa, dịch vụ, đơn giá, số lượng, thành tiền và thuế suất áp dụng, nhằm đảm bảo tính minh bạch và tuân thủ quy định pháp luật. Đối với phòng khám, hoạt động cung cấp thuốc và dịch vụ điều trị bệnh được coi là hai loại hình riêng biệt, nhưng có thể được ghi nhận trên cùng một hóa đơn nếu chúng phát sinh từ cùng một giao dịch với người mua.

Xem thêm: Em nhờ anh chị tư vấn giúp em với ạ, hiện cô em kinh doanh quần áo đã mở hộ kinh doanh trước đây rồi, nghĩa vụ đóng thuế năm 2025 đã hoàn tất, bây giờ cô muốn chuyển lại cho con cô đứng giấy phép kinh doanh nên muốn lên thuế báo ngưng từ tháng 2/2026, cho em hỏi vậy giờ cô em vẫn làm sổ S2A trong tháng 1 rồi sau đó làm tờ khai thuế tháng 1 thôi hay sao ạ?

Khả năng xuất một tờ hóa đơn kết hợp thuốc và dịch vụ điều trị

Có thể xuất một tờ hóa đơn duy nhất bao gồm cả thuốc và dịch vụ điều trị bệnh, miễn là hóa đơn được lập chi tiết, phân biệt rõ ràng từng loại để tránh nhầm lẫn về thuế và kế toán. Cụ thể, phần dịch vụ điều trị bệnh (như khám, chẩn đoán, điều trị) sẽ được áp dụng thuế suất 0% theo Luật Thuế giá trị gia tăng số 2024, vì đây là hoạt động y tế được miễn thuế. Phần thuốc và vật tư y tế sẽ chịu thuế suất 10% theo quy định tại Điều 10 Luật Thuế GTGT 2024, trừ trường hợp thuốc thuộc diện miễn thuế đặc biệt (như thuốc thiết yếu theo danh mục của Bộ Y tế). Thông tư 69/2025/TT-BTC hướng dẫn chi tiết việc kê khai, khấu trừ thuế GTGT đối với hàng hóa, dịch vụ y tế, yêu cầu hóa đơn phải liệt kê riêng từng dòng để cơ quan thuế dễ dàng kiểm tra và xác định thuế suất phù hợp.

Lưu ý khi lập hóa đơn

Xem thêm: Các bác cho hỏi hộ kinh doanh cũ dưới 500 triệu thì năm nay kê khai 2 lần vào 31/7 với 30/1 năm sau đúng không ạ, hay chỉ kê khai 1 lần vào năm sau thôi? Còn 2 lần là để cho hộ mới ra kinh doanh năm 2026 ạ?

• Hóa đơn phải ghi đầy đủ thông tin người bán (phòng khám), người mua, ngày lập, và các chi tiết cụ thể như tên thuốc, số lượng, đơn giá; tên dịch vụ điều trị, mô tả ngắn gọn.
• Nếu thuốc được kê đơn kèm dịch vụ điều trị, cần đảm bảo hóa đơn phản ánh đúng bản chất giao dịch để tránh bị cơ quan thuế điều chỉnh, dẫn đến phạt hành chính theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.
• Phòng khám nên sử dụng phần mềm hóa đơn điện tử được cơ quan thuế chấp thuận để tự động tính thuế suất, giúp giảm sai sót và dễ dàng báo cáo định kỳ.

Việc tuân thủ quy định xuất hóa đơn giúp phòng khám tránh rủi ro pháp lý, tối ưu hóa chi phí thuế và nâng cao uy tín với bệnh nhân. Đồng thời, đảm bảo dòng tiền kế toán rõ ràng, hỗ trợ quản lý hiệu quả hoạt động kinh doanh. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công ty dịch vụ kế toán ACC.