Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công ty dịch vụ kế toán ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Nguyên nhân chênh lệch thuế GTGT đầu ra do làm tròn

Chênh lệch 2 đồng trong thuế giá trị gia tăng (GTGT) đầu ra thường phát sinh từ việc làm tròn số thập phân trên từng hóa đơn GTGT, nơi giá trị thuế được làm tròn đến đơn vị đồng.

Khi tổng hợp dữ liệu từ nhiều hóa đơn, tổng thuế GTGT có thể lệch nhẹ so với 10% giá trị hàng hóa bán ra chịu thuế, dẫn đến hệ thống kê khai thuế điện tử (như eTax) không chấp nhận do yêu cầu khớp chính xác số liệu.

Theo Luật Quản lý thuế 2019, người nộp thuế phải kê khai chính xác, nhưng các sai sót nhỏ do làm tròn kỹ thuật không bị coi là vi phạm nếu được giải trình kịp thời.

Quy định pháp lý liên quan đến xử lý chênh lệch nhỏ

Theo Thông tư 94/2025/TT-BTC khi kê khai thuế GTGT hàng quý, số liệu trên tờ khai phải dựa trên tổng hợp hóa đơn thực tế, và cơ quan thuế chấp nhận chênh lệch nhỏ do làm tròn mà không yêu cầu điều chỉnh nếu có giải trình. Luật Quản lý thuế 2019 quy định người nộp thuế có quyền sửa chữa sai sót trong thời hạn 10 năm kể từ ngày hết hạn nộp tờ khai, miễn là không làm thay đổi nghĩa vụ thuế lớn. Trong trường hợp tạm nộp bằng 10% tổng giá trị hàng hóa để hệ thống chấp nhận, đây là biện pháp tạm thời hợp lý, nhưng cần xử lý chênh lệch thực tế để tránh phát sinh phạt chậm nộp (0,03%/ngày theo Luật Quản lý thuế 2019).

Xem thêm: Chào mọi người. Em làm sản xuất than ép. Em có mua than từ hộ kinh doanh và cá nhân thu gom bột than nguyên liệu ở dưới Hậu Giang, mà họ không thể cung cấp được hóa đơn điện tử, và không nhận chuyển khoản (chỉ lấy tiền mặt). Em làm hợp đồng mua bán, giấy phiếu nhận tiền. Dựa vào thông tin này em có thể làm bảng kê 01/CNKD để chứng minh đầu vào được không. Mong anh chị chỉ dẫn em để hợp thức hóa được đầu vào. Cảm ơn anh chị.

Để xử lý chênh lệch 2 đồng Anh/Chị có thể áp dụng các biện pháp sau mà không cần điều chỉnh toàn bộ tờ khai. Cụ thể:

• Biện pháp 1: Nộp bổ sung chênh lệch qua tài khoản thuế

Chuyển khoản bổ sung 2 đồng vào tài khoản thuế GTGT đầu ra qua ngân hàng hoặc cổng eTax, kèm ghi chú "Bổ sung chênh lệch làm tròn thuế GTGT quý 4". Sau đó, lưu biên bản nội bộ ghi nhận giao dịch này để đối chiếu khi quyết toán. Biện pháp này đơn giản, không phát sinh phí, và phù hợp nếu kỳ kê khai đã đóng.

• Biện pháp 2: Gửi giải trình đến cơ quan thuế

Soạn văn bản giải trình gửi Chi cục Thuế quản lý (qua eTax hoặc trực tiếp), nêu rõ nguyên nhân chênh lệch do làm tròn hóa đơn, đính kèm bảng tổng hợp hóa đơn và tính toán chi tiết. Cơ quan thuế sẽ xác nhận chấp nhận mà không yêu cầu nộp thêm theo Luật Quản lý thuế 2019.

• Biện pháp 3: Điều chỉnh tờ khai nếu cần thiết

Nếu chênh lệch ảnh hưởng đến quyết toán năm, sử dụng chức năng "Điều chỉnh" trên eTax để bổ sung 2 đồng vào chỉ tiêu thuế GTGT đầu ra, kèm giải trình. Không áp dụng nếu đã nộp tạm và hệ thống khóa kỳ.

Bước 1: Kiểm tra và tổng hợp dữ liệu

Xem thêm: Anh chị cho em hỏi tờ khai bổ sung quý 3/2025 nộp trên dịch vụ công hay nộp trên thuế điện tử ạ? Dịch vụ công chỉ cho tra cứu từ 1/7/2025 trở về trước, nên em không tìm được tờ khai đã nộp để bổ sung.

Thu thập toàn bộ hóa đơn GTGT đầu ra quý 4, tính toán lại tổng giá trị chịu thuế và thuế GTGT theo công thức 10%, so sánh với số trên tờ khai tạm nộp. Lập bảng Excel chi tiết để xác nhận chênh lệch chính xác 2 đồng, đảm bảo không có sai sót khác. Bước này giúp tránh nhầm lẫn và làm cơ sở cho giải trình.

Bước 2: Thực hiện bổ sung hoặc giải trình

Chọn biện pháp phù hợp  trong vòng 10 ngày kể từ ngày phát hiện lệch (theo Luật Quản lý thuế 2019). Nộp qua eTax để có mã xác nhận, hoặc trực tiếp tại Chi cục Thuế nếu cần. Giữ biên bản nội bộ ký xác nhận để lưu trữ hồ sơ kế toán.

Bước 3: Theo dõi và quyết toán

Sau khi xử lý, kiểm tra thông báo từ cơ quan thuế trên eTax. Khi quyết toán thuế năm, ghi nhận chênh lệch đã xử lý vào phần thuyết minh để đảm bảo tính chính xác tổng thể, tránh phạt hành chính (Luật Quản lý thuế 2019).

Việc tuân thủ xử lý kịp thời giúp tránh phạt chậm nộp và đảm bảo hồ sơ thuế minh bạch, giảm rủi ro kiểm tra sau. Đồng thời, áp dụng phần mềm kế toán tự động làm tròn sẽ hạn chế sai sót tương tự trong tương lai. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công ty dịch vụ kế toán ACC.